Можно ли взять уже испеченное печенье и положить его в каменную банку, а можно в духовку?

Нет . Консервирование — это метод консервирования продуктов путем их обработки и запечатывания в герметичные контейнеры. Испеченное печенье уже готово и в дальнейшей обработке не нуждается. Консервирование печенья в каменной банке не приведет к созданию безопасного или съедобного продукта.