To af de mere kontroversielle konserveringsmidler almindeligt anvendes i store-købte cookies er Butylhydroxyanisol (BHA) og Butylhydroxytoluen (BHT). Begge konserveringsmidler anvendes også i andre grain baserede elementer såsom korn, kage mix, emballerede husholdningsmaskiner og emballerede kager. Selvom der ikke har været nogen endelig link til konsum, i visse lab tests begge stoffer menes at have forårsaget svulster hos rotter. Dette har forårsaget uro i nogle forbrugerrettigheder grupper, men begge fortsat anvendes i mange store- købte emballerede cookies.
Natriumbenzoat

Et andet materiale, der anvendes i cookies til bevare friskhed er natriumbenzoat. Denne kemiske bruges i alt fra over-the-counter hostesaft, at kulsyreholdige sodavand, til fastfood hamburgere. Dets vandopløselighed og manglende smag gør det til det første valg for at bevare en bred vifte af letfordærvelige fødevarer. Der er også nogle sundhedsmæssige betænkeligheder med natriumbenzoat, som det forsøgsvis er blevet bundet til bestemte former for DNA-skader, selvom ingen officiel forbindelse er blevet gjort.
Citronsyre

En mere naturlig mulighed for at bevare cookies er citronsyre. Denne mild syre er den foretrukne metode til at bevare citrus og frugt-flavored cookies, da den skærper smagen af ​​hvad det tilsættes til mens udlån det en vis grad af surhed. Af tilsvarende grunde er det ikke almindeligt anvendt i krydrede cookies, såsom dem, der anvender chokolade. I forhold til kommercielle konserveringsmidler, Citronsyre har dog ingen negativ indflydelse på kroppen og er sikkert for daglige forbrug.
Andre konserverende Metoder

Ved bagning cookies fra hjemmet, der er utallige måder at bevare dit hårde arbejde uden at ty til kemikalier eller tilsætningsstoffer. Blot at placere cookies i fryseren vil være helt effektiv på kort sigt. Andre praktiske metoder omfatter forsegling cookies i vakuum forseglede poser eller placere dem i plastbeholdere. Den naturlige tørhed af cookies vil gøre resten af ​​arbejdet. For mange dagligdags metoder til mad konservering er langt den mest effektive for hjemmelavede cookies.