ciało Apple ma związków chemicznych zwanych związków fenolowych, które reagują z tlenem pod wpływem powietrza. Raz skórka jabłka jest złamany, te związki są narażone na działanie tlenu i enzymów źrenicy zwanej oksydazy polifenolowe spowodować reakcję brązowienia. Jednym ze sposobów utrzymania pokrojone jabłka z brązowienia jest przechowywać je w wodzie kwaśnej - dodać jedną część soku z cytryny na pięć części wody, aby zapobiec jabłka z brązowienia. Chłodzenie spowalnia także proces brązowienia.
Po jabłko jest cięty, następuje utlenianie szybko.
Jabłko Rot

Grzyby mogą chwycić jabłek, w szczególności poprzez nakłucie lub Rana, która łamie inne skórę jabłka. Najczęstszymi przyczynami są zgnilizny jabłek z grzybów Penicillium i expansum Monilinia fructigena. Grzyby te żywią się i zabijać komórki, które tworzą jabłko. Grzybów wytwarzają enzymy pektynowe rozkładają pektyny jabłek w celu odsłonięcia składników odżywczych do komórek grzybów. Różne grzyby i pleśnie produkują różne wzory uszkodzenia rot.
Rot z grzybów zwykle chwyta na przerwę w skórze.
Wilgotności, światła i ciepła

Czynniki środowiskowe mogą wpływa na szybkość jabłka zgniją. Przechowywaniu jabłek w chłodnym miejscu spowolni wystąpienia zgnilizny, ale nie zmniejsza stopień uszkodzenia przez długie okresy czasu. Umiarkowanej wilgotności nie przyspiesza gnicie. Podczas jabłka dojrzewają wymagają światła, grzyby i pleśnie, które powodują gnicie nie wymagają światła. Światło, które nie towarzyszy ciepła nie powinna przyspieszyć jabłko gnicie.